1. Архив
  2. №5-6, 2023
  3. ОТ СТАНДАРТНОЙ К ПЕРСОНИФИЦИРОВАННОЙ ПОМОЩИ: ФАРМАКОГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ПРИ НОВОЙ КОРОНАВИРУСНОЙ ИНФЕКЦИИКАК СРЕДСТВО ОПТИМИЗАЦИИ КЛИНИЧЕСКОЙ ПРАКТИКИ

http://doi.org/10.26347/1607-2502202305-06041-048

ОТ СТАНДАРТНОЙ К ПЕРСОНИФИЦИРОВАННОЙ ПОМОЩИ: ФАРМАКОГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ПРИ НОВОЙ КОРОНАВИРУСНОЙ ИНФЕКЦИИКАК СРЕДСТВО ОПТИМИЗАЦИИ КЛИНИЧЕСКОЙ ПРАКТИКИ

Н.А. Воробьева, С.Л. Рашева, А.С. Воронцова, А.И. Воробьева

Работа выполнена в соответствии с этическими принципами проведения исследований с участием человека Хельсинской Декларации Всемирной Медицинской Ассоциации (Declaration of Helsinki), пересмотр 2013 г.

Для цитирования: Воробьева Н.А., Рашева С.Л., Воронцова А.С., Воробьева А.И. От стандартной к персонифицированной помощи: фармакогенетический анализ при новой коронавирусной инфекции как средство оптимизации клинической практики. Проблемы стандартизации в здравоохранении. 2023; 5-6: 41-48. https//doi.org/10.26347/1607-2502202305-06041-048

Конфликт интересов. Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.

Исследование выполнено в рамках финансирования государственное задание Рег. № НИОКТР 121030300111-7.

Сведения об авторах:

Воробьева Надежда Александровна7* — доктор медицинских наук, профессор, заслуженный врач РФ, заведующий кафедрой клинической фармакологии и фармакотерапии ФГБУ ВО Северный государственный медицинский университет Минздрава России, 163000, Архангельск, пр. Троицкий, 51 — ответственный за переписку. 163000 Архангельск (Россия), улица Набережная Северной Двины, д. 71, кв. 231. E-mail: nadejdav0@gmail.com ORCID iD 0000-0001-6613-2485 SPIN-код 4545-2558 authorID: 637455 Researcher ID - E-4115-2018 Scopus Author ID - 57200828966

Рашева Светлана Леонидовна — студентка 6 курса ФГБУ ВО Северный государственный медицинский университет Минздрава России, 163000, Архангельск, пр. Троицкий, 51. E-mail: sveta.rasheva@gmail.com ORCID ID: 0009-0009-4447-042X

Воронцова Александра Сергеевна — младший научный сотрудник ЦНИЛ ФГБУ ВО Северного государственного медицинского университета Минздрава России, 163000, Архангельск, пр. Троицкий, 51. E-mail: baklab1gkb@yandex.ru ORCID iD 0000-0003-3643-0515

Воробьева Алена Ивановна — научный сотрудник ЦНИЛ ФГБУ ВО Северного государственного медицинского университета Минздрава России, 163000, Архангельск, пр. Троицкий, 51. E-mail: greeenhamster@rambler.ru ORCID iD 0000-0003-4817-6884 Scopus Author ID - 57200384556

ФГБОУ ВО Северный государственный медицинский университет Министерства здравоохранения Российской Федерации

Фармакогенетика является важным элементом оптимизации клинического подхода направления, учитывающий не только рекомендации и стандарты, но и генетические особенности метаболизма пациента. Цель исследования: анализ распространенности генетического полиморфизма системы цитохрома Р-450 у пациентов с инфекцией COVID-19 как возможность персонализации стандартной терапии.Материалы и методы. Проспективное клинико-лабораторное исследование выполнено в период пандемии COVID-19 (декабрь 2020 г. — март 2021 г.) на базе Регионального центра антитромботической терапии ГБУЗ АО «Первая городская клиническая больница им. Е.Е. Волосевич» (г. Архангельск) с включением 63 пациентов с тяжелым течением новой коронавирусной инфекции. Использовались образцы геномной ДНК, полученной из лейкоцитов периферической крови. Определение последовательности полиморфизма генов системы биотрансформации CYP2C9*2 (rs1799853), CYP2C9*3 (rs1057910) и CYP3A4*1A/1B (rs2740574) выполнялось методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) синтеза ДНК в режиме «реального времени» на амплификаторе Real-Time CFX96. Статистические расчеты осуществлялись с использованием программы «STATA 14», критерия Харди—Вайнберга и хи-квадрат Пирсона.Результаты. У обследованных пациентов наиболее часто встречались гетерозиготные генотипы генов CYP2C9*2 (rs1799853) и CYP2C9*3 (rs1057910) (76,19% и 77,78% соответственно) и дикий гомозиготный генотип CYP3A4*1A/1B (rs2740574) (71,43%). Было выявлено неблагоприятное сочетание гетерозиготного генотипа и мутантного гомозиготного полиморфизма гена CYP2C9*3 (rs1057910) с приемом надропарина кальция (χ2 = 3,3642, p = 0,067 и χ2 = 3,3642, p = 0,067), а также с одновременным приемом надропарина кальция и фавипиравира (χ2 = 4,8395, p = 0,028 и χ2 = 4,8395, p = 0,028).Заключение. Результаты исследования указывают на важность индивидуального подхода наряду с учетом стандартов медицинской помощи к выбору фармакотерапии при инфекции COVID-19.
Ключевые слова: персонифицированный подход, полиморфизм генов; COVID-19; коронавирусная инфекция; фармакогенетика; фармакогенетическое тестирование

FROM STANDARD TO PERSONALIZED CARE: PHARMACOGENETIC ANALYSIS FOR COVID-19 AS A WAY OF OPTIMIZING CLINICAL PRACTICE

N.A. Vorobyeva, S.L. Rasheva, A.S. Vorontsova, A.I. Vorobyeva

This work has been carried out in accordance with the ethical principles for medical research involving human subjects developed by WMA Declaration of Helsinki (ed. 2013).

For citation: Vorobyeva NA, Rasheva SL, Vorontsova AS, Vorobyeva AI. From standard to personalized care: pharmacogenetic analysis for COVID-19 as a way of optimizing clinical practice. Health Care Standardization Problems. 2023;5-6:41-48. https//doi.org/10.26347/1607-2502202305-06041-048

Conflicts of interest. The authors declare no competing interests.

The study has been funded within the state order No. NIOKTR 121030300111-7.

Authors and affiliations:

Prof. Nadezhda A. Vorobyeva*8 — PhD, DSc (Med.), Distinguished Physician of the Russian Federation, Head of Pharmacology and Pharmacotherapy Department, Northern State Medical University, Arkhangelsk, Russia. E-mail: nadejdav0@gmail.com. https://orcid.org/0000-0001-6613-2485 SPIN-code 4545-2558 author ID: 637455 Researcher ID - E-4115-2018 Scopus Author ID — 57200828966

Svetlana L. Rasheva — 6th year student, Northern State Medical University, Arkhangelsk, Russia. E-mail: sveta.rasheva@gmail.com https://orcid.org/0009-0009-4447-042X.

Alexandra S. Vorontsova — Junior Researcher, Major Research Laboratory, Northern State Medical University, Arkhangelsk, Russia. E-mail: baklab1gkb@yandex.ru https://orcid.org/0000-0003-3643-0515

Alena I. Vorobyeva — Researcher, Major Research Laboratory, Northern State Medical University, Arkhangelsk. E-mail: greeenhamster@rambler.ru https://orcid.org/0000-0003-4817-6884 Scopus Author ID: 57200384556

Northern State Medical University

The COVID-19 pandemic made personalized medicine especially relevant. Pharmacogenetics is an important element of this area as it considers genetic characteristics of a patient.Objective. The study analyzes prevalence of genetic polymorphism of the cytochrome P-450 system in COVID-19 patients to provide the personalized treatment.Methods. A prospective clinical and laboratory study was performed during the COVID-19 pandemic (December 2020 — March 2021) on the basis of the Regional Center for Antithrombotic Therapy (First City Clinical Hospital named after E.E. Volosevich, Arkhangelsk) and included 63 patients with a severe course of COVID-19. A sample of genomic DNA obtained from peripheral blood leukocytes was used as the material for the study. Determination of the sequence of polymorphism of the genes of the biotransformation system CYP2C9*2 (rs1799853), CYP2C9*3 (rs1057910) and CYP3A4*1A/1B (rs2740574) was performed by polymerase chain reaction (PCR) DNA synthesis in the «real time» mode on a Real-Time CFX96 amplifier. Statistical calculations were carried out using the STATA 14 program, the Hardy—Weinberg test and Pearson's chi-square test.Results. The examined patients had the most common heterozygous genotypes of CYP2C9*2 (rs1799853) and CYP2C9*3 (rs1057910) genes (76.19% and 77.78%, respectively) and the wild homozygous genotype of CYP3A4*1A/1B (rs2740574) (71.43%). An unfavorable interaction of the heterozygous genotype and mutant homozygous polymorphism of the CYP2C9*3 gene (rs1057910) was revealed when taking nadroparin calcium (χ2 = 3.3642, p = 0.067 and χ2 = 3.3642, p = 0.067), as well as when simultaneously taking nadroparin calcium and favipiravir (χ2 = 4.8395, p = 0.028 and χ2 = 4.8395, p = 0.028).Interpretation. The results of the study indicate the importance of an individual approach to the choice of pharmacotherapy for COVID-19 and the necessaty of further research in the field of pharmacogenetics of this infection.
Keywords: gene polymorphism; COVID-19; coronavirus infection; pharmacogenetics; pharmacogenetic testing